世界
在秀吉等人离开后，世界进程按照原剧情发展。
整个新第三东京市的电力被人为切断，紧接着，像是一只蜘蛛的雨天使来袭。
没有了秀吉和黑啸龙的干扰，雨天使径直前往莉莉丝的所在地。
在碇真嗣三人费尽千幸万苦从外部到达内部，并且坐上了手动启动的三架。
然后，剧情再次改变
原本应该来到直达最终教条区的竖井正上方，然后就开始灌注强腐蚀性液体雨天使，在融化了表层的装甲后，停止了进一步的腐蚀液的释放。
它用它在底部的眼睛，看着正在向上爬的三架
突如其来的变化，让碇真嗣三人都愣住了。
“吱吱吱吱”
雨天使发出了诡异的声音，紧接着，细长的腿带着它离开了通道的正上方。
待到三台上到地面时，他们看见雨天使正在远处，看着他们。
“这是怎么回事？”
“吱吱吱吱呀！”
雨天使继续发出了诡异的声音，眼睛则看着面前的三台。
“管那么多干嘛！干掉它就对了！”
此时，二号机突然上前，手中的步枪向着面前的雨天使喷出了火舌。
哒哒哒哒哒哒！
上百枚子弹打穿了雨天使的身体，随即它瘫在了地上。
“吱呀”
轰！
伴随着巨大的蘑菇云，雨天使爆炸开来。
然而，那诡异的场景，却让人不安
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讨伐雨天使几天后
会议室
摆着经典的碇司令，看着面前带着数十个编号的屏幕，一言不发。
“莫名而来的搅局者，已经完全扰乱了我们的计划。”
“除了天使外，末世的黑龙也出现了吗？”
“人类补全计划能否成功，已经成了问题。”
面对成员的话，碇司令没有出声。
“都这样了，人类补全计划真的还有必要考虑吗？”
“你是想放弃人类的补全，去乞求异族的施舍吗？！”
“我们认为的完美生物，在那只黑龙面前不堪一击，而至今为止，他的实力还是个迷，这难道还不足以让我们重新考虑吗？”
“你这是对人类的背叛！”
会议逐渐变为了争吵，黑啸龙的出现以及所展现的力量，已经动摇了成员的信仰了。
故此，对于是否继续实行不完美的人类补全计划，成员们，已经出现了分歧。
“好了！”
一个威严的声音阻止了进一步的争吵，一时间，会议室安静了下来。
“计划仍要继续，但是需要修改。”那个声音说道。“碇源堂，我们需要你去进一步试探他的实力，为了以后的可能”
“我明白了”碇司令回应道。
“就这样吧，会议解散。”
光屏一个个暗下来，只有碇司令还在那里，一言不发
许久后，他伸出了自己的手，一支u盘躺在其中。
“新的可能吗？”
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基地中，一个诡异的黑色球体正在地球的高空轨道上，无数的攻击卫星向其攻击，却没有丝毫作用。
空天使，这名巨大的使徒以自己的身体作为武器，从地球高空轨道向着所在地落下。
巨大的质量与从高空落下所获得的超高的速度，使得空天使变成了一颗巨大的炸弹，注意彻底摧毁新的三东京市以及其地下设施。
军方的行动已经宣告失败，空天使的准确落点不明，葛城美里只能按照原作那样，在可能的范围内平均分配三台，试图接住它。
然而，一个局外人的出现，又一次打乱了原剧情的发展。
“”
刚刚结束冥想的黑啸龙抬着头，看着离自己越来越近的空天使，一阵沉默。
“感觉刚刚消除了火气又上来了，我这位置，已经够远了啊”黑啸龙捂着脸，头疼道。“这个位置，已经处于边缘了啊”
“你这在空中连续的转弯，不怕闪了腰吗”
空天使越来越近，而因为位置太过于边缘，三台都赶不上了。
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